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hors_les_murs:hack2eaux:note_sur_la_dormance_des_graines

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hors_les_murs:hack2eaux:note_sur_la_dormance_des_graines [2023/09/14 11:19] – [Classification par Baskin et Baskin] ajout de tableau xavcchors_les_murs:hack2eaux:note_sur_la_dormance_des_graines [2023/09/14 13:01] (Version actuelle) – [Classement par dormance endogène et dormance exogène] arrangement du classement xavcc
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 ==== Classification par Baskin et Baskin ==== ==== Classification par Baskin et Baskin ====
  
-^Tableau 1<font inherit/inherit;;inherit;;#2980b9></font> __ <font inherit/inherit;;inherit;;#ffffff>Système de classification de la dormance des semences</font> __  (modifié d'après Nikolaeva, 1977 ; Baskin et Baskin, 1998). //Ce système n'inclut pas les graines avec des embryons indifférenciés.// | +{{ :hors_les_murs:hack2eaux:baskin-table1.png?nolink&600 | A classification system for seed dormancy 
-|**Classe A** - Dormance physiologique (DP) +Jerry MBaskin and Carol C. BaskinSeed Science Research (2004141–16 DOI: 10.1079/SSR2003150}}
-     * Niveaux - profond, intermédiaire, non profond\\ +
-* Types - 1, 2, 3, 4 et 5 (de la DP non profonde, voir Fig2)\\ +
-+
-|**Classe B** - Dormance morphologique (DM) \\ //(n'inclut pas les semences à embryons indifférenciés)//+
-|**Classe C** - Dormance morphophysiologique (MPD) +
-     * Niveaux - simple non profond, simple intermédiaire, simple profond, simple profond, épicotyle simple profond, double simple profond, complexe non profond, complexe intermédiaire et complexe profond (voir le tableau ci-dessous).\\ +
-* complexe, complexe intermédiaire et complexe profond (voir tableau 3) //(n'inclut pas les graines avec des embryons indifférenciés).// \\ +
-+
-|**Classe D** - Dormance physique (PY\\ //(doit probablement être subdiviséevoir le texte)// | +
-|**Classe E** - Dormance combinée (PY + PD) +
-     * Niveau - DP non profond (les types 1 et 2 sont probablement représentés)\\ +
-|+
  
 === Dormance primaire === === Dormance primaire ===
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       * **__La dormance physiologique__  (DPg)**  est la forme la plus abondante et se retrouve dans les graines de la majorité des angiospermes. Elle met en cause un ou plusieurs mécanismes physiologiques qui proviennent de l’embryon et qui inhibent l’émergence de la radicule (Baskin et Baskin, 1998)((Baskin, C.C., and J.M. Baskin. 1998. Seeds : Ecology, Biogeography, and Evolution of dormancy and Germination. Pages 1-666. Academic Press. San Diego. CA. USA)) . Toutefois, les structures qui entourent l’embryon, telles l'albumen ou les téguments, ne sont pas à négliger comme cause potentielle de ce type de dormance. Alors que la dormance morphologique est rattachée à un embryon immature qualifié de rudimentaire ou linéaire, la dormance physiologique n'est liée à aucun critère morphologique et peut se présenter chez n’importe quel type de graines (Nivot 2005)((Nivot,N. (2005) Essais de germination et de bouturage de six espèces indigènes sciaphytes du Canada, Thèse, Université Laval)) .       * **__La dormance physiologique__  (DPg)**  est la forme la plus abondante et se retrouve dans les graines de la majorité des angiospermes. Elle met en cause un ou plusieurs mécanismes physiologiques qui proviennent de l’embryon et qui inhibent l’émergence de la radicule (Baskin et Baskin, 1998)((Baskin, C.C., and J.M. Baskin. 1998. Seeds : Ecology, Biogeography, and Evolution of dormancy and Germination. Pages 1-666. Academic Press. San Diego. CA. USA)) . Toutefois, les structures qui entourent l’embryon, telles l'albumen ou les téguments, ne sont pas à négliger comme cause potentielle de ce type de dormance. Alors que la dormance morphologique est rattachée à un embryon immature qualifié de rudimentaire ou linéaire, la dormance physiologique n'est liée à aucun critère morphologique et peut se présenter chez n’importe quel type de graines (Nivot 2005)((Nivot,N. (2005) Essais de germination et de bouturage de six espèces indigènes sciaphytes du Canada, Thèse, Université Laval)) .
         * **La dormance de l'épicotyle**  est le terme utilisé pour décrire la dormance des graines dans les espèces où il y a un retard d'environ 3-4 semaines (ou plus) dans l'émergence de la pousse après l'émergence de la radicule.         * **La dormance de l'épicotyle**  est le terme utilisé pour décrire la dormance des graines dans les espèces où il y a un retard d'environ 3-4 semaines (ou plus) dans l'émergence de la pousse après l'émergence de la radicule.
-      * **__La dormance physique (DP)**  qui est liée à une imperméabilité des graines (Baskin & Baskin 2004((Baskin, J. M., and C. C. Baskin. 2004. A classification system for seed dormancy. Seed Science Research 14:1-16.)) , 2014) ou des fruits (Li, Baskin & Baskin 1999)((Li, X., J. M. Baskin, and C. Baskin. 1999. Anatomy of two mechanisms of breaking physical dormancy by experimental treatments in seeds of two North American Rhus species (Anacardiaceae). American Journal of Botany 86:1505-1511))   à l’eau causée par la présence du péricarpe et de l’endocarpe (Li, Baskin & Baskin 1999). +       
-      * **La __dormance morphologique (DM)**  est due à la présence d’un embryon sous développé en termes de taille (Finch-Savage & Leubner-Metzger 2006). La germination ne peut avoir lieu tant que l’embryon n’est pas arrivé au terme de sa croissance. Avec 2 sous-dormances :+      * **__La dormance physique (DP)__**  qui est liée à une imperméabilité des graines (Baskin & Baskin 2004((Baskin, J. M., and C. C. Baskin. 2004. A classification system for seed dormancy. Seed Science Research 14:1-16.)) , 2014) ou des fruits (Li, Baskin & Baskin 1999)((Li, X., J. M. Baskin, and C. Baskin. 1999. Anatomy of two mechanisms of breaking physical dormancy by experimental treatments in seeds of two North American Rhus species (Anacardiaceae). American Journal of Botany 86:1505-1511))   à l’eau causée par la présence du péricarpe et de l’endocarpe (Li, Baskin & Baskin 1999). 
 +       
 +      * **La __dormance morphologique__ (DM)**  est due à la présence d’un embryon sous développé en termes de taille (Finch-Savage & Leubner-Metzger 2006). La germination ne peut avoir lieu tant que l’embryon n’est pas arrivé au terme de sa croissance. Avec 2 sous-dormances :
         * **Dormance physiologique de l'épicotyle**  : La dormance épicotyle est le terme utilisé pour décrire la dormance des graines dans les espèces où il y a un retard d'environ 3-4 semaines (ou plus) dans l'émergence de la pousse après l'émergence de la radicule.         * **Dormance physiologique de l'épicotyle**  : La dormance épicotyle est le terme utilisé pour décrire la dormance des graines dans les espèces où il y a un retard d'environ 3-4 semaines (ou plus) dans l'émergence de la pousse après l'émergence de la radicule.
-      * **__La dormance morpho-physiologique (DMPg)**  qui combine la dormance morphologique et physiologique (Baskin & Baskin 2004). Avec+       
 +      * **__La dormance morpho-physiologique__ (DMPg)**  qui combine la dormance morphologique et physiologique (Baskin & Baskin 2004). Avec
         * dormance morphophysiologique de l'épicotyle (MPD)         * dormance morphophysiologique de l'épicotyle (MPD)
-      * **__La dormance physique-physiologique (DPqPg)**  qui associe dormance tégumentaire et dormance physiologique (Nikolaeva 1977 ; Baskin & Baskin 2001, 2004). La germination ne peut se produire que si les deux types de dormance sont levés à la fois. Pour certaines espèces la dormance physique est levée avant la dormance physiologique et réciproquement pour d’autres (Finch-Savage & Leubner-Metzger 2006)((Finch-Savage, W. E., and G. Leubner-Metzger. 2006. Seed dormancy and the control of germination. The New phytologist 171:501-23)) .+       
 +      * **__La dormance physique-physiologique__ (DPqPg)**  qui associe dormance tégumentaire et dormance physiologique (Nikolaeva 1977 ; Baskin & Baskin 2001, 2004). La germination ne peut se produire que si les deux types de dormance sont levés à la fois. Pour certaines espèces la dormance physique est levée avant la dormance physiologique et réciproquement pour d’autres (Finch-Savage & Leubner-Metzger 2006)((Finch-Savage, W. E., and G. Leubner-Metzger. 2006. Seed dormancy and the control of germination. The New phytologist 171:501-23)) . 
 +      * 
 {{:hors_les_murs:hack2eaux:13595_2020_1010_fig1_html.png?nolink&600}} {{:hors_les_murs:hack2eaux:13595_2020_1010_fig1_html.png?nolink&600}}
  
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       * **__La dormance chimique__  (DC)**  (non incluse dans la classification de Baskin & Baskin en 2014) qui est provoquée par la présence dans le péricarpe d’inhibiteurs de la croissance de l’embryon. Le principal inhibiteur est l’acide abscissique (ABA) (Wang et al. 1994((Wang, M., R. Bakhuizen, S. Heimovaara-Dijkstra, M. J. Van Zeijl, M. A. De Vries, J. M. Van Beckum, and K.M.C. Sinjorgo. 1994. The role of ABA and GA in barley grain dormancy: a comparative study between embryo and aleurone dormancy. Russian Journal of Plant Physiology. 41:577 584))   ; Foley 2001((Foley, M. E. 2001. Review article Seed dormancy : an update on terminology , physiological genetics , and quantitative trait loci regulating germinability. Weed Science 49:305-317)) )       * **__La dormance chimique__  (DC)**  (non incluse dans la classification de Baskin & Baskin en 2014) qui est provoquée par la présence dans le péricarpe d’inhibiteurs de la croissance de l’embryon. Le principal inhibiteur est l’acide abscissique (ABA) (Wang et al. 1994((Wang, M., R. Bakhuizen, S. Heimovaara-Dijkstra, M. J. Van Zeijl, M. A. De Vries, J. M. Van Beckum, and K.M.C. Sinjorgo. 1994. The role of ABA and GA in barley grain dormancy: a comparative study between embryo and aleurone dormancy. Russian Journal of Plant Physiology. 41:577 584))   ; Foley 2001((Foley, M. E. 2001. Review article Seed dormancy : an update on terminology , physiological genetics , and quantitative trait loci regulating germinability. Weed Science 49:305-317)) )
-<note tip>Chez Baskin & Baskin voir [[https://wiki.kaouenn-noz.fr/_media/hors_les_murs:hack2eaux:seeds._ecology_biogeography_and_evolution_of_dormancy_and_germination_--_carol_c._baskin_and_jerry_m._baskin_auth._--_2_2014_--_academic_press_--_9780124166776_--_bec9e0c94eaa6198d00efbbefb92d810_--_anna_s_archiv.pdf#%5B%7B%22num%22%3A546%2C%22gen%22%3A0%7D%2C%7B%22name%22%3A%22XYZ%22%7D%2Cnull%2Cnull%2C0%5D|Abscisic Acid and Development of Dormancy</note>+<note tip>Chez Baskin & Baskin voir [[https://wiki.kaouenn-noz.fr/_media/hors_les_murs:hack2eaux:seeds._ecology_biogeography_and_evolution_of_dormancy_and_germination_--_carol_c._baskin_and_jerry_m._baskin_auth._--_2_2014_--_academic_press_--_9780124166776_--_bec9e0c94eaa6198d00efbbefb92d810_--_anna_s_archiv.pdf#%5B%7B%22num%22%3A546%2C%22gen%22%3A0%7D%2C%7B%22name%22%3A%22XYZ%22%7D%2Cnull%2Cnull%2C0%5D|Abscisic Acid and Development of Dormancy]]</note>
  
  
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 <note tip>Chez Baskin & Baskin :"[[https://wiki.kaouenn-noz.fr/_media/hors_les_murs:hack2eaux:seeds._ecology_biogeography_and_evolution_of_dormancy_and_germination_--_carol_c._baskin_and_jerry_m._baskin_auth._--_2_2014_--_academic_press_--_9780124166776_--_bec9e0c94eaa6198d00efbbefb92d810_--_anna_s_archiv.pdf#%5B%7B%22num%22%3A639%2C%22gen%22%3A0%7D%2C%7B%22name%22%3A%22XYZ%22%7D%2Cnull%2Cnull%2C0%5D|Chemical Dormancy, a Part of Physiological <note tip>Chez Baskin & Baskin :"[[https://wiki.kaouenn-noz.fr/_media/hors_les_murs:hack2eaux:seeds._ecology_biogeography_and_evolution_of_dormancy_and_germination_--_carol_c._baskin_and_jerry_m._baskin_auth._--_2_2014_--_academic_press_--_9780124166776_--_bec9e0c94eaa6198d00efbbefb92d810_--_anna_s_archiv.pdf#%5B%7B%22num%22%3A639%2C%22gen%22%3A0%7D%2C%7B%22name%22%3A%22XYZ%22%7D%2Cnull%2Cnull%2C0%5D|Chemical Dormancy, a Part of Physiological
 Dormancy]]"</note> Dormancy]]"</note>
 +
 +{{:hors_les_murs:hack2eaux:baskin-table2.png?nolink&600|}}
 +
 +Le classement de Nikolaeva (1977) comprend :
 +
 +  * 3 types
 +    * Dormance exogène [A]
 +      * Physique
 +      * Chimique
 +      * Mécanique
 +    * Dormance endogène
 +      * Physiologique [C]
 +      * Morphologique [B]
 +      * Morpho-physiologique [B-C]
 +    * Mixte exogène et endogène [A-B-C]
 +
 +Baskin & Baskin classe ainsi
 +
 +  * 2 divisions
 +    * __Division 1__. **Dormance Imposé** [forcé, quiescent] (nondormant, semence ne germe pas en raison de l'absence de conditions environnementales favorables, y compris la lumière) ; pas de sous-catégories
 +    * __Division 2__. **Dormance Organique** [innée] (dormante, la graine ne germe pas en raison des propriétés des graines elles-mêmes)
 +      * **__Subdivision 1. Exogène [A]__**
 +        * **Classe 1. Physique [Aph]** (pas de sous-catégories, mais voir Baskin & Baskin, 2004)
 +      * **__Subdivision 2. Endogène [B et C]__**
 +          * **Classe 2. Morphologique [B]** (une seule catégorie)
 +          * **Classe 3. Physiologique [C]**
 +            * __Subclass 1. Regular__
 +              * Level 1. Nondeep (C1)a
 +                * Type 1. C 1b or C 1a
 +                * Type 2. C 1b or C 1a
 +                * Type 3. C 1b or C 1a
 +                * Type 4. C 1b
 +                * Type 5. C 1b or C 1a
 +              * Level 2. Intermediate (C2)
 +                * Type 1. (C2b) [not confirmed]
 +                * Type 2. (C2a )
 +              * Level 3. Deep (C3 )
 +                * Type 1. (C3b)
 +                * Type 2. (C3a )
 +            * __Subclass 2. Epicotyl__
 +              * Level 1. Nondeep
 +                * Type 1. C nd(root)-Cp01b (shoot)
 +                * Type 2. C nd(root)-Cp1b (shoot)
 +                * Type 3. C u1b (root)-Cu1b (shoot)
 +              * Level 2. Deepb,c,d
 +                * Type 1. C nd(root)-C3a(shoot)
 +                * Type 2. C 1b(root)-Cp03b (shoot)
 +                * Type 3. C nd(root)-Cp3b (shoot)
 +                * Type 4.Cu1b (root)-Cu3b (shoot)
 +           * **Class 4. Morphophysiological [B-C]**
 +             * __Subclass 1. Simple__
 +               * Level 1. Nondeep (C1Bb)
 +                 * Type 1. (C1bBb) (C1bB-C1b sensu Nikolaeva)
 +                 * Type 2. (C1a Bb) (C1a B-C1b sensu Nikolaeva)
 +               * Level 2. Intermediate (C1bBb-C2a ) e
 +               * Level 3. Deep (C1b Bb-C3a )e
 +               * Level 4. Nondeep epicotylb,f
 +                  * Type 1. C ndBb(root)-C1b(shoot)
 +                  * Type 2. C 1bBb(root)-C1b(shoot)
 +                  * Type 3. C 1bBb(root)-C1b B0b(shoot)
 +                  * Type 4. C 1bBb(root)-C1a (shoot)
 +               * Level 5. Deep epicotyl f,g
 +                  * Type 1. C 3bBb(root)-C3b(shoot)
 +                  * Type 2. C 1bBb(root)-C3a (shoot)
 +                  * Type 3. C 1bBb(root)-C3 B0a (shoot)
 +                  * Type 4. C 1bBb(root)-C3a Ba (shoot)
 +                * Level 6. Deep simple double
 +                  * Type 1. C 3aBb” (root)-Ce3a (shoot)
 +                  * Type 2. C 3aBb0 (root)-Ch3a (shoot)
 +             * __Subclass 2. Complexe__
 +                * Level 1. Nondeep (C1b1aBa-C 1a)
 +                * Level 2. Intermediate (C2Ba -C2a )
 +                * Level 3. Deep (C3a Ba -C3a )
 +          * **Class 5. Combinational [A-C]**
 +              * Level 1. Nondeep (Aph-C1)
 +                * Type 1. (Aph-C1b)
 +                * Type 2. (Aph-C1a )
 +              * Level 2. Intermediate (Aph-C2) [not confirmed]
 +                * Type 1 (Aph -C2b)
 +                  * Type 2 (Aph -C2a)
 +              * Level 3. Deep (Aph-C 3) [not confirmed]
 +                * Type 1 (Aph -C3b)
 +                * Type 2 (Aph -C3a)
 +
 +Cette classification fait l'objet de discussions et d'efforts de précisions par actualisation((//Seed dormancy revisited: Dormancy-release pathways and environmental interactions// Byron B. Lamont, Juli G. Pausas, 13 January 2023 https://doi.org/10.1111/1365-2435.14269)) ((Nonogaki H. //Seed germination and dormancy: The classic story, new puzzles, and evolution//. J Integr Plant Biol. 2019 May;61(5):541-563. doi: 10.1111/jipb.12762. Epub 2019 Feb 27. PMID: 30565406.)) ((//Seed Biology Updates – Highlights and New Discoveries in Seed Dormancy and Germination Research//, Hiroyuki Nonogaki, Front. Plant Sci., 11 April 2017
 +Sec. Plant Development and EvoDevo. Volume 8 - 2017  https://doi.org/10.3389/fpls.2017.00524))
 ===== Les options de sortie et/ou rupture de dormance ===== ===== Les options de sortie et/ou rupture de dormance =====
  
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